Религия всегда являлась неотъемлемой частью жизни общества, а в частности – его духовной составляющей. С самого начала образования приходов на территории г. Рыбницы и Рыбницкого района церковь берет на себя огромную духовнопросветительскую роль, особенно в образовании и нравственном становлении подрастающего поколения.
Во многих архивных записях даже не указывается точное время появления первого православного храма, а только основание прихода и появление духовного настоятеля. Приднестровье на протяжении XVIII века было одним из оплотов православия в Польше. Документы того времени подтверждают наличие на территории Рыбницкого района деревянных церквей.
История образования села Попенки Рыбницкого района тесно связана с историей храма святого апостола и евангелиста Иоанна Богослова.
9 октября православная церковь отмечает день апостола и евангелиста Иоанна Богослова. Именно в эту дату село Попенки Рыбницкого района отмечает храмовой праздник села.
Первый храм в с. Попенки появился по одним данным в 1790 г., а согласно другим источникам – в 1795 г. Он был деревянным и носил имя святого Архистратига Михаила.
В церковных архивах найден важный документ – «Метрическая книга» XIX века на польском языке, по которой можно заключить, что в селе в 1790 году уже был самостоятельный приход со своим священником Иоаном Радзинским.
Приход являлся униатским, и в 1794 г. был переведен в каноническую юрисдикцию Русской православной церкви. В дальнейшем в селе «иждивением и старанием помещиков и прихожан была построена новая церковь – каменная, однопрестольная, крытая листовым железом». Её постройка была начата в 1834 г., а окончена в 1857 г. По рассказам старожил села, главный строитель церкви – помещик Иоанн Визерский пожелал, чтобы новоустроенный храм был освящен во имя Апостола Иоанна Богослова. Таким образом престол храма освятили во имя святого апостола и евангелиста Иоанна Богослова. Иконостас был трехъярусный, колокольня при церкви – деревянная, на каменном фундаменте. В 1870 — 1888 годы на средства прихожан здание церкви было обновлено.
В 30-е годы XX века церковь в с. Попенки была закрыта, богослужения возобновились в период румынской оккупации. В послевоенные годы храм оставался действующим до апреля 1961 г., после чего вновь был закрыт.
Церковная жизнь в селе возобновилась в конце 90-х XX века. Здание храма было передано Тираспольско-Дубоссарской епархии. С 18 июня 1997 г. и по сей день в церкви регулярно совершаются богослужения.
О. Кузьмин, заведующая филиалом-музеем истории с. Попенки.